MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006361	GAC	2	6	4	9	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
2	NC_006361	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
3	NC_006361	GCT	2	6	156	161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
4	NC_006361	TCG	2	6	172	177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
5	NC_006361	AGG	2	6	185	190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
6	NC_006361	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
7	NC_006361	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
8	NC_006361	GCC	2	6	307	312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
9	NC_006361	G	6	6	359	364	0 %	0 %	100 %	0 %	54021965
10	NC_006361	AGG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
11	NC_006361	GCC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
12	NC_006361	GC	3	6	463	468	0 %	0 %	50 %	50 %	54021965
13	NC_006361	C	6	6	495	500	0 %	0 %	0 %	100 %	54021965
14	NC_006361	GCC	2	6	502	507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
15	NC_006361	CGAC	2	8	593	600	25 %	0 %	25 %	50 %	54021965
16	NC_006361	GAC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
17	NC_006361	CGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
18	NC_006361	CGGG	2	8	647	654	0 %	0 %	75 %	25 %	54021965
19	NC_006361	CCG	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
20	NC_006361	CGG	2	6	684	689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
21	NC_006361	CGC	2	6	746	751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
22	NC_006361	ACCG	3	12	805	816	25 %	0 %	25 %	50 %	54021965
23	NC_006361	CGG	2	6	827	832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
24	NC_006361	CGA	3	9	873	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
25	NC_006361	CCCCGG	2	12	941	952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
26	NC_006361	CTC	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021965
27	NC_006361	CTG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
28	NC_006361	TCA	2	6	1205	1210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021965
29	NC_006361	CGA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
30	NC_006361	CGC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
31	NC_006361	CTG	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
32	NC_006361	CGA	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
33	NC_006361	AAGG	2	8	1303	1310	50 %	0 %	50 %	0 %	54021965
34	NC_006361	AGG	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
35	NC_006361	TTC	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54021965
36	NC_006361	CAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021965
37	NC_006361	TCC	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021965
38	NC_006361	GCC	2	6	1386	1391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
39	NC_006361	AGC	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
40	NC_006361	GAG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
41	NC_006361	GCC	2	6	1461	1466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
42	NC_006361	AAG	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54021965
43	NC_006361	ACG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
44	NC_006361	GGT	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021965
45	NC_006361	CCG	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
46	NC_006361	CCGGG	2	10	1763	1772	0 %	0 %	60 %	40 %	54021965
47	NC_006361	ACCAC	2	10	1874	1883	40 %	0 %	0 %	60 %	54021965
48	NC_006361	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
49	NC_006361	CGCA	2	8	2896	2903	25 %	0 %	25 %	50 %	54021966
50	NC_006361	GCC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
51	NC_006361	CGG	2	6	2935	2940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
52	NC_006361	TGC	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
53	NC_006361	CGC	2	6	3016	3021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
54	NC_006361	GCC	2	6	3057	3062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
55	NC_006361	GGA	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021966
56	NC_006361	GCA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
57	NC_006361	GTCGCC	2	12	3260	3271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54021966
58	NC_006361	GCCG	2	8	3272	3279	0 %	0 %	50 %	50 %	54021966
59	NC_006361	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
60	NC_006361	GGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021966
61	NC_006361	GGC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
62	NC_006361	ACCG	2	8	3350	3357	25 %	0 %	25 %	50 %	54021966
63	NC_006361	CG	3	6	3394	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	54021966
64	NC_006361	GGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
65	NC_006361	CGGA	2	8	3513	3520	25 %	0 %	50 %	25 %	54021966
66	NC_006361	CTG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
67	NC_006361	GCCG	2	8	3539	3546	0 %	0 %	50 %	50 %	54021966
68	NC_006361	CAC	3	9	3550	3558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021966
69	NC_006361	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
70	NC_006361	AC	3	6	3610	3615	50 %	0 %	0 %	50 %	54021966
71	NC_006361	GCGCG	2	10	3682	3691	0 %	0 %	60 %	40 %	54021966
72	NC_006361	CTG	2	6	3722	3727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
73	NC_006361	CCG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
74	NC_006361	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
75	NC_006361	TGG	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021966
76	NC_006361	CAC	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021966
77	NC_006361	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
78	NC_006361	CTG	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
79	NC_006361	GGA	3	9	3913	3921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021966
80	NC_006361	CGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
81	NC_006361	ACCT	2	8	3971	3978	25 %	25 %	0 %	50 %	54021966
82	NC_006361	AACGGC	2	12	4156	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
83	NC_006361	CGG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
84	NC_006361	GC	3	6	4260	4265	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
85	NC_006361	CG	3	6	4342	4347	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
86	NC_006361	GTT	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54021967
87	NC_006361	GGA	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
88	NC_006361	GCG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
89	NC_006361	CGA	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
90	NC_006361	CG	3	6	4513	4518	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
91	NC_006361	TGC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021967
92	NC_006361	GCC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
93	NC_006361	CCG	2	6	4586	4591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
94	NC_006361	GGCC	2	8	4626	4633	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
95	NC_006361	CGC	2	6	4635	4640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
96	NC_006361	TGG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021967
97	NC_006361	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
98	NC_006361	GC	5	10	4783	4792	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
99	NC_006361	CG	3	6	4793	4798	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
100	NC_006361	ACG	3	9	4799	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
101	NC_006361	GAG	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
102	NC_006361	ATC	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021967
103	NC_006361	CGA	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
104	NC_006361	GCCA	2	8	4945	4952	25 %	0 %	25 %	50 %	54021967
105	NC_006361	GCGCT	2	10	4978	4987	0 %	20 %	40 %	40 %	54021967
106	NC_006361	CCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021967
107	NC_006361	GCA	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
108	NC_006361	TGC	3	9	5030	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021967
109	NC_006361	CGA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
110	NC_006361	CGGCGC	2	12	5065	5076	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
111	NC_006361	GCC	2	6	5086	5091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
112	NC_006361	GGC	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
113	NC_006361	CGG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
114	NC_006361	GGA	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
115	NC_006361	GGCC	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	54021967
116	NC_006361	CCG	2	6	5727	5732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
117	NC_006361	CCG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
118	NC_006361	GGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021968
119	NC_006361	GCC	3	9	5778	5786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
120	NC_006361	CG	3	6	5817	5822	0 %	0 %	50 %	50 %	54021968
121	NC_006361	GC	3	6	5840	5845	0 %	0 %	50 %	50 %	54021968
122	NC_006361	GGT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021968
123	NC_006361	GCCCG	2	10	5877	5886	0 %	0 %	40 %	60 %	54021968
124	NC_006361	GCT	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021968
125	NC_006361	GGGC	2	8	5986	5993	0 %	0 %	75 %	25 %	54021968
126	NC_006361	GGA	2	6	6002	6007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021968
127	NC_006361	CGC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
128	NC_006361	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
129	NC_006361	CTG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021968
130	NC_006361	GTG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021968
131	NC_006361	CCGGC	2	10	6169	6178	0 %	0 %	40 %	60 %	54021968
132	NC_006361	CG	3	6	6226	6231	0 %	0 %	50 %	50 %	54021968
133	NC_006361	CAG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021969
134	NC_006361	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021969
135	NC_006361	CCG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
136	NC_006361	CGC	2	6	6473	6478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
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263	NC_006361	TCA	2	6	10805	10810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021971
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266	NC_006361	CGG	2	6	10915	10920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021971
267	NC_006361	ACACCG	2	12	10928	10939	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54021971
268	NC_006361	CG	3	6	10938	10943	0 %	0 %	50 %	50 %	54021971
269	NC_006361	GCT	2	6	10959	10964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021971
270	NC_006361	CGA	2	6	10971	10976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
271	NC_006361	AGA	2	6	11036	11041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54021971
272	NC_006361	CGA	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
273	NC_006361	GC	3	6	11115	11120	0 %	0 %	50 %	50 %	54021971
274	NC_006361	CGA	2	6	11130	11135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
275	NC_006361	CGA	2	6	11163	11168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
276	NC_006361	CGA	2	6	11208	11213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
277	NC_006361	GTC	2	6	11239	11244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021971
278	NC_006361	GCG	2	6	11306	11311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021971
279	NC_006361	GAC	2	6	11344	11349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
280	NC_006361	CTT	2	6	11361	11366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54021971
281	NC_006361	CCAC	2	8	11375	11382	25 %	0 %	0 %	75 %	54021971
282	NC_006361	GCT	2	6	11388	11393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021971
283	NC_006361	TTC	2	6	11395	11400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54021971
284	NC_006361	CAA	2	6	11403	11408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021971
285	NC_006361	ACCGC	2	10	11453	11462	20 %	0 %	20 %	60 %	54021971
286	NC_006361	GC	3	6	11461	11466	0 %	0 %	50 %	50 %	54021971
287	NC_006361	CTG	2	6	11485	11490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021971
288	NC_006361	ATC	2	6	11521	11526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021971
289	NC_006361	CCA	2	6	11567	11572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021971
290	NC_006361	AAG	2	6	11587	11592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54021971
291	NC_006361	GCG	2	6	11624	11629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021971
292	NC_006361	ACG	2	6	11657	11662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
293	NC_006361	TCG	2	6	11666	11671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021971
294	NC_006361	TGCTC	2	10	11678	11687	0 %	40 %	20 %	40 %	54021971
295	NC_006361	CGA	3	9	11691	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
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297	NC_006361	CGA	2	6	11748	11753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021971
298	NC_006361	GGGCC	2	10	11769	11778	0 %	0 %	60 %	40 %	54021971
299	NC_006361	TGT	2	6	11822	11827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54021971
300	NC_006361	GTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021971
301	NC_006361	ACCT	2	8	11851	11858	25 %	25 %	0 %	50 %	54021971
302	NC_006361	CGGG	2	8	11873	11880	0 %	0 %	75 %	25 %	54021971
303	NC_006361	GAG	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021971
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312	NC_006361	CG	3	6	12135	12140	0 %	0 %	50 %	50 %	54021971
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379	NC_006361	CGT	2	6	14708	14713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021973
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383	NC_006361	TGG	2	6	14816	14821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021973
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385	NC_006361	CGA	2	6	14975	14980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021973
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387	NC_006361	TCCGC	2	10	15017	15026	0 %	20 %	20 %	60 %	54021973
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389	NC_006361	GCCCG	2	10	15108	15117	0 %	0 %	40 %	60 %	54021973
390	NC_006361	CT	3	6	15162	15167	0 %	50 %	0 %	50 %	54021973
391	NC_006361	CGAT	2	8	15253	15260	25 %	25 %	25 %	25 %	54021974
392	NC_006361	TCG	2	6	15274	15279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021974
393	NC_006361	GCG	2	6	15285	15290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021974
394	NC_006361	GTG	2	6	15354	15359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021974
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396	NC_006361	GC	3	6	15417	15422	0 %	0 %	50 %	50 %	54021974
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